ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารเคมีเกษตรและเภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะในการพัฒนายาฆ่าหญ้าและยาฆ่าเชื้อรา หมู่ไตรฟลูออร์เมทอกซีช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและลิโพฟิลิก ทำให้มีคุณค่าต่อการออกแบบโมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมของเหลวผลึกและโพลิเมอร์พิเศษ เนื่องจากคุณสมบัติทางอิเล็กทรอนิกส์และโครงสร้างที่เป็นเอกลักษณ์