ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์ยาและสารเคมีเกษตร โดยเฉพาะในการพัฒนาสารประกอบอินทรีย์ฟลูออรีน หมู่ดิฟลูออโรเอทอกซีช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและลิโพฟิลิก ทำให้มีคุณค่าในการออกแบบยาเพื่อปรับปรุงชีวเภสัชจลนศาสตร์ ใช้บ่อยในปฏิกิริยาครอส-คัปเปลิง เช่น ซูซูกิหรืออัลแมน เพื่อสร้างระบบอะโรมาติกซับซ้อนในเคมียารักษา นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมวัสดุฟังก์ชันและผลึกเหลวเนื่องจากคุณสมบัติอิเล็กทรอนิกส์และโครงสร้างที่เป็นเอกลักษณ์