ใช้เป็นตัวกลางหลักในการสังเคราะห์สารเคมีเกษตรและเภสัชภัณฑ์ โดยมีบทบาทสำคัญในการสร้างอนุพันธ์ยูเรียและคาร์บาเมต ปฏิกิริยาของมันกับอะมีนและแอลกอฮอล์ทำให้มีคุณค่าต่อการสร้างส่วนประกอบออกฤทธิ์สำหรับสารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าแมลง นอกจากนี้ยังใช้ในการพัฒนาโพลิเมอร์พิเศษและวัสดุฟังก์ชันนัลที่ต้องการการเชื่อมข่ายแบบควบคุมหรือการรับรู้โมเลกุลเฉพาะเจาะจง โดยเฉพาะในสารกำจัดศัตรูพืช เช่น ยาฆ่าแมลงและสารต้านเชื้อรา เนื่องจากหมู่ไอโซไซยาเนตมีปฏิกิริยาได้ดีกับสารประกอบที่มีหมู่อะมิโนหรือหมู่ไฮดรอกซิล ทำให้สามารถสร้างยูเรียหรือยูรีเทนได้ ซึ่งโครงสร้างเหล่านี้มักพบในสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ และใช้เป็นตัวกลางในการผลิตยาบางชนิดที่ต้องการโครงสร้างฟีนิลที่มีหมู่เมท็อกซีและฮาโลเจน เพื่อเพิ่มความสามารถในการซึมผ่านของเซลล์หรือความจำเพาะต่อเป้าหมายทางชีวภาพ เนื่องจากมีความไวต่อความชื้น จึงจัดการภายใต้สภาวะไร้น้ำในกระบวนการอุตสาหกรรม