Tridecanophenone ใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์เป็นสารตัวกลางในการผลิตสารเคมีต่างๆ รวมถึงยา พยาธิกำจัดศัตรูพืช และสารประกอบพิเศษ โครงสร้างของมันทำให้เป็นบล็อกก่อสร้างที่มีคุณค่าในการสร้างโมเลกุลซับซ้อน โดยเฉพาะในการพัฒนาส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) ที่ต้องการฟังก์ชันคีโตนเฉพาะ นอกจากนี้ยังมีการประยุกต์ใช้ในการเตรียมของเหลวผลึกและวัสดุขั้นสูงอื่นๆ เนื่องจากความสามารถในการกำหนดการจัดเรียงโมเลกุลและความเสถียร ในงานวิจัย มันทำหน้าที่เป็นตัวเร่งปฏิกิริยาสำหรับศึกษาปฏิกิริยาและกลไกที่เกี่ยวข้องกับคีโตน ช่วยในการพัฒนาเส้นทางสังเคราะห์ใหม่ บทบาทของมันในการสังเคราะห์น้ำหอมและรสชาติก็值得การกล่าวถึง โดยมีส่วนช่วยในการสร้างสารประกอบหอมกลิ่นเฉพาะตัว