ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะยาที่ออกฤทธิ์ต่อระบบประสาทส่วนกลางและยาแก้ซึมเศร้า เป็นส่วนประกอบพื้นฐานในปฏิกิริยาอินทรีย์ที่ต้องการฟังก์ชันคีโตนไฮดรอกซีที่ได้รับการป้องกัน กลุ่มเบนซิลทำหน้าที่เป็นกลุ่มป้องกันสำหรับแอลกอฮอล์ ช่วยให้สามารถทำปฏิกิริยาเลือกที่ตำแหน่งอื่นในโมเลกุลได้ หลังจากการแปลงที่ต้องการ กลุ่มเบนซิลสามารถถูกกำจัดด้วยไฮโดรเจนโอลิซิสเพื่อเผยให้เห็นสารประกอบไฮดรอกซิลอิสระ นิยมใช้ในงานวิจัยและพัฒนาสำหรับการออกแบบโมเลกุลชีวภาพที่ซับซ้อน