ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยา โดยเฉพาะในการพัฒนายาต้านความดันโลหิตสูงและยารักษาโรคหัวใจและหลอดเลือด โครงสร้างของมันช่วยให้เกิดการสร้างสารประกอบเฮเทอโรไซคลิกผ่านปฏิกิริยาการสร้างวง ทำให้มีคุณค่าในการสร้างโมเลกุลชีวภาพที่基于ไธโอฟีน ใช้บ่อยในเคมีอินทรีย์เพื่อนำหมู่ chloroalkyl-thiophene เข้าไป ซึ่งพบในยารักษาบางชนิดและวัสดุฟังก์ชันนัล นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยเพื่อเตรียมอนุพันธ์ในศึกษาความสัมพันธ์โครงสร้าง-กิจกรรม (SAR)