ใช้เป็นสารตั้งต้นหลักในการสังเคราะห์ยาและสารเคมีเกษตร โดยเฉพาะในการพัฒนาสารประกอบอะโรมาติกที่ถูก fluorinated และ brominated ตัวแทนฮาโลเจนหลายตัวช่วยให้สามารถทำปฏิกิริยา cross-coupling ได้อย่างเลือกสรร ทำให้มีคุณค่าในการสร้างโมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อน นิยมใช้ในปฏิกิริยา Suzuki, Stille, และ Ullmann เพื่อสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนและคาร์บอน-เฮเทโรอะตอม นอกจากนี้ยังใช้ในการเตรียมวัสดุฟังก์ชันนัล รวมถึงผลึกเหลวและเซมิคอนดักเตอร์อินทรีย์ ซึ่งตำแหน่งของฮาโลเจนมีอิทธิพลต่อสมบัติทางอิเล็กทรอนิกส์