ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยาฟลูออรีนและสารเคมีเกษตร โดยเฉพาะในการพัฒนาโมเลกุลชีวภาพที่การแทนที่ด้วยฟลูออรีนช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและการซึมผ่านเยื่อหุ้มเซลล์ หน้าที่ของไอโอดีนช่วยให้สามารถทำการฟังก์ชันนาไลเซชันเพิ่มเติมผ่านปฏิกิริยาครอส-คัปเปลิง ทำให้มีคุณค่าในเคมียารักษาโรคสำหรับการสร้างระบบอะโรมาติกที่ซับซ้อน นิยมใช้ในการเตรียมตัวยับยั้งคินาสและการบำบัดแบบกำหนดเป้าหมายอื่นๆ ในการค้นคว้ายา