ใช้ในงานสังเคราะห์สารเคมีอินทรีย์ โดยเฉพาะเป็นตัวกลางสำคัญในการสร้างสารประกอบทางเภสัชกรรม เช่น ยับยั้ง kinase สำหรับการรักษามะเร็ง โครงสร้าง 1,3-ไดออกโซเลนทำหน้าที่ปกป้องหมู่อัลดีไฮด์ชั่วคราว ช่วยให้สามารถดัดแปลงวงอะรีลได้อย่างเลือกสรร โดยป้องกันปฏิกิริยาไม่พึงประสงค์ ทำให้มีคุณค่าในเคมียารักษาโรคสำหรับสร้างอนุพันธ์ที่มีกิจกรรมทางชีวภาพดีขึ้น นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยเพื่อพัฒนาโมเลกุลอินทรีย์ฟลูออรีน ซึ่งอะตอมฟลูออรีนช่วยเพิ่มความเสถียรทางเมแทบอลิซึมและความสัมพันธ์ในการจับเป้า มักนำไปใช้ในปฏิกิริยาการจับคู่ข้าม เช่น Suzuki-Miyaura เพื่อสร้างระบบอะโรมาติกซับซ้อนในการค้นคว้ายา