KJ Pyr 9 ถูกใช้อย่างกว้างขวางในงานวิจัยด้านชีววิทยาโมเลกุลและเซลล์ โดยเฉพาะในการศึกษาเกี่ยวกับกระบวนการ autophagy ซึ่งเป็นกระบวนการในระดับเซลล์ที่เกี่ยวข้องกับการย่อยสลายและนำกลับมาใช้ใหม่ของส่วนประกอบเซลล์ที่เสียหายหรือไม่จำเป็น สารนี้มีบทบาทในการยับยั้ง autophagy ผ่านการปิดกั้นกิจกรรมของโปรตีน ULK1 ซึ่งเป็น kinase สำคัญในการเริ่มต้นกระบวนการ autophagy ทำให้สามารถศึกษาผลกระทบของการยับยั้ง autophagy ต่อเซลล์และเนื้อเยื่อได้ นอกจากนี้ยังมีการนำไปใช้ในการวิจัยโรคต่างๆ เช่น มะเร็ง โรคทางระบบประสาท และโรคติดเชื้อ เพื่อเข้าใจกลไกการเกิดโรคและพัฒนาวิธีการรักษาใหม่ๆ KJ Pyr 9 จึงเป็นเครื่องมือสำคัญในห้องปฏิบัติการเพื่อการค้นพบทางวิทยาศาสตร์และการแพทย์