ใช้อย่างแพร่หลายในการไบโอคอนจูเกชันและการติดฉลาก โดยสารประกอบนี้มีคุณค่าอย่างยิ่งในการเชื่อมโยงไบโอโมเลกุลกับแท็กเรืองแสง กลุ่มอะไซด์ช่วยให้เกิดปฏิกิริยาเคมีคลิก โดยเฉพาะกับโมเลกุลที่ฟังก์ชันนัลด้วยอัลไคน์ ส่งเสริมการคอนจูเกชันที่แม่นยำและมีประสิทธิภาพ ช่องว่าง PEG ช่วยเพิ่มความละลายและลดการขัดขวางเชิง steric ทำให้เหมาะสำหรับใช้ในการถ่ายภาพเซลล์สด ฟลว์ไซโตเมทรี และกล้องจุลทรรศน์เรืองแสง สีเรืองแสง Cy5 ให้การเรืองแสงใกล้แถบอินฟราเรดที่แข็งแกร่ง ช่วยให้ถ่ายภาพเนื้อเยื่อลึกและลดการรบกวนจาก autofluorescence ในพื้นหลัง สารประกอบนี้ยังใช้ในการพัฒนาระบบการส่งยาที่กำหนดเป้าหมาย ซึ่งช่วยติดตามการกระจายและการดูดซึมของยารักษาในระบบชีวภาพ ความหลากหลายของมันทำให้เป็นเครื่องมือสำคัญในการวิจัยทางชีวการแพทย์และการวินิจฉัย