BDP FL-PEG5-azide ใช้กันอย่างแพร่หลายในการเชื่อมต่อทางชีวภาพ (bioconjugation) และการติดฉลาก (labeling) เนื่องจากมีกลุ่มฟังก์ชัน azide ที่ช่วยให้เกิดปฏิกิริยา click chemistry ได้อย่างมีประสิทธิภาพ โดยเฉพาะอย่างยิ่งมีคุณค่าต่อการพัฒนาโพรบเรืองแสง (fluorescent probes) สำหรับการถ่ายภาพและติดตามโมเลกุลทางชีวภาพในเซลล์หรือเนื้อเยื่อที่มีชีวิต สเปเซอร์ PEG5 ช่วยเพิ่มความละลายในน้ำและลดการขัดขวางทาง steric ทำให้เหมาะสำหรับการติดกับโปรตีน เปปไทด์ หรือโมเลกุลชีวภาพอื่นๆ โดยไม่รบกวนการทำงาน สารเคมีนี้ยังใช้ในการสังเคราะห์ระบบส่งยา (drug delivery systems) ซึ่งสามารถใช้เชื่อมต่อลิแกนด์สำหรับการกำหนดเป้าหมายหรือยารักษา นอกจากนี้ คุณสมบัติเรืองแสงช่วยให้สามารถตรวจสอบกระบวนการในเซลล์แบบเรียลไทม์ สนับสนุนการวิจัยที่เกี่ยวข้องกับมะเร็ง ภูมิคุ้มกันวิทยา และชีววิทยาของโมเลกุล