ใช้เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์ยาและสารเคมีเกษตร โดยเฉพาะในการพัฒนาสารประกอบออร์แกนิกฟลูออรีน กลุ่มฟังก์ชันอะไซด์และฟลูออรีนช่วยให้เกิดปฏิกิริยาเลือกเฉพาะ ทำให้มีคุณค่าในปฏิกิริยา click chemistry สำหรับการเชื่อมต่อทางชีวภาพ (bioconjugation) และการค้นพบยา โดยเฉพาะการสร้างพันธะไตรอะโซลผ่านปฏิกิริยากับอัลไคน์ภายใต้การเร่งด้วยทองแดง นิยมใช้ในงานวิจัยด้านชีวเคมีและเภสัชกรรมเพื่อติดฉลากโมเลกุลหรือเชื่อมต่อโปรตีน เอนไซม์ หรือดีเอ็นเอในระบบชีวภาพ รวมถึงการเตรียมสารประกอบติดฉลากรังสีสำหรับการถ่ายภาพ positron emission tomography (PET) เนื่องจากฟลูออรีนที่สามารถแทนที่ด้วยฟลูออรีน-18 นอกจากนี้ยังใช้ในวิทยาศาสตร์วัสดุสำหรับสร้างโพลิเมอร์พิเศษที่มีความเสถียรทางความร้อนและเคมีสูง ความเป็นอะไซด์ทำให้ทำหน้าที่เป็นตัวเร่งปฏิกิริยาได้ดีในสภาพแวดล้อมควบคุม และมักใช้ในระบบส่งยาแบบเจาะจงหรือการพัฒนายาที่ต้องการการควบคุมสูง การจัดการอย่างปลอดภัยเป็นสิ่งจำเป็นเนื่องจากศักยภาพในการระเบิดของสารที่มีอะไซด์