ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในเคมีชีวภาพและโปรตีโอมิกส์ โดยเฉพาะในปฏิกิริยาคลิกเคมี (click chemistry) กลุ่มอาไซด์สามารถทำปฏิกิริยา copper-catalyzed azide-alkyne cycloaddition (CuAAC) ได้อย่างมีประสิทธิภาพภายใต้สภาวะที่เป็นมิตรต่อระบบชีวภาพ ช่วยในการติดฉลากและเชื่อมต่อกับโมเลกุลชีวภาพที่มีกลุ่มอัลไคน์ เช่น เพปไทด์ โปรตีน และกรดนิวคลีอิก ทำให้เหมาะสำหรับการติดตามหรือตรวจจับโมเลกุลในเซลล์

กลุ่มซัลโฟนิลอาไซด์ที่มีความไวต่อแสง ยังสามารถใช้ในการทำฟอโต้ลิเทอเรชัน (photolabeling) เพื่อจับปฏิกิริยาระหว่างโปรตีนกับลิแกนด์ หรือศึกษาปฏิสัมพันธ์ของโมเลกุลในระบบชีวภาพ

แกน tetrafluorobenzene ที่ขาดอิเล็กตรอนช่วยเพิ่มความเสถียร ความตอบสนอง และความสามารถในการละลายในตัวทำละลายอินทรีย์ ทำให้สารนี้เหมาะสำหรับการปรับเปลี่ยนพื้นผิวแบบเลือกสรรและการฟังก์ชันนาไลเซชันของวัสดุ นอกจากนี้ ยังใช้ในการพัฒนาโปรบฟลูออเรสเซนต์และสาร中间ตัวทางเภสัชกรรมที่ต้องการปฏิกิริยาควบคุมเฉพาะที่

กลุ่มกรดคาร์บอกซิลิกช่วยให้สามารถ derivatize เพิ่มเติม เช่น การสร้างพันธะอะไมด์ เพื่อรวมเข้าในโครงสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อน