สารนี้มักใช้ในการเชื่อมโยงโมเลกุลทางชีวภาพ โดยเฉพาะในกระบวนการปรับเปลี่ยนโปรตีนหรือเปปไทด์ เนื่องจากมีกลุ่มเอซิโดที่สามารถทำปฏิกิริยาได้ดีกับกลุ่มอัลไคน์ผ่านปฏิกิริยา Click Chemistry นอกจากนี้ กลุ่ม PFP ester ยังช่วยให้สารสามารถจับกับกลุ่มเอมีนหรือไฮดรอกซิลได้อย่างมีประสิทธิภาพ ทำให้เป็นสารสำคัญในงานวิจัยทางชีวเคมีและเภสัชวิทยา เช่น การพัฒนายาหรือการติดตามโมเลกุลในเซลล์