Streptolydigin ถูกใช้หลักๆ ในงานวิจัยเป็นสารยับยั้งที่แรงต่อ RNA polymerase ของแบคทีเรีย โดยหยุดกระบวนการถอดรหัสในแบคทีเรียได้อย่างมีประสิทธิภาพผ่านการจับกับเอนไซม์ ทำให้เป็นเครื่องมือที่มีค่าในการศึกษาการแสดงออกของยีนแบคทีเรียและกลไกการถอดรหัส การประยุกต์ใช้ขยายไปถึงการพัฒนายาปฏิชีวนะชนิดใหม่ เนื่องจากการเข้าใจการโต้ตอบของมันกับ RNA polymerase สามารถช่วยในการออกแบบยาใหม่เพื่อต่อสู้กับเชื้อแบคทีเรียที่ดื้อยาปฏิชีวนะ นอกจากนี้ Streptolydigin ยังถูกใช้ในงานทดลองชีวเคมีเพื่อตรวจสอบด้านโครงสร้างและหน้าที่ของ RNA polymerase ให้ข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับพื้นฐานโมเลกุลของการยับยั้งการถอดรหัส