3-Fluoro-4-ไอโอโดเบนซาลดีไฮด์ถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในด้านการสังเคราะห์สารเคมี โดยเฉพาะในกระบวนการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนสำหรับการวิจัยทางเภสัชวิทยา มันเป็นสารตั้งต้นสำคัญในการผลิตสารประกอบที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ เช่น ยาต้านมะเร็งและยาต้านจุลชีพ นอกจากนี้ ยังใช้ในอุตสาหกรรมอิเล็กทรอนิกส์สำหรับการผลิตวัสดุที่มีคุณสมบัติพิเศษ เช่น สารกึ่งตัวนำและวัสดุเรืองแสง เนื่องจากโครงสร้างที่มีทั้งฟลูออรีนและไอโอดีน ทำให้มันมีประโยชน์ในการปรับปรุงประสิทธิภาพของวัสดุเหล่านี้