3-อะมิโน-2-ฟลูออโรเบนซาไมด์ ถูกนำมาใช้หลักๆ ในสาขาเคมียารักษาโรคเป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบเภสัชกรรมต่างๆ โครงสร้างของมันที่มีทั้งกลุ่มอะมิโนและอะตอมฟลูออรีน ทำให้เป็นส่วนประกอบที่มีคุณค่าอย่างยิ่งในการพัฒนายาที่มีศักยภาพในการรักษา โดยเฉพาะอย่างยิ่ง มักถูกนำไปใช้ในการสร้างตัวยับยั้งโมเลกุลขนาดเล็กที่เล็งเป้าไปยังเอนไซม์หรือโปรตีนเฉพาะที่เกี่ยวข้องกับเส้นทางของโรค สารประกอบนี้แสดงให้เห็นถึงความเป็นไปได้ในการพัฒนายาต้านมะเร็ง โดยที่อนุพันธ์ของมันสามารถรบกวนการเจริญเติบโตและการแพร่กระจายของเนื้องอก นอกจากนี้ ยังถูกสำรวจในการออกแบบยาต้านการอักเสบและยาต้านจุลชีพ โดยอาศัยความสามารถในการปรับเปลี่ยนกิจกรรมทางชีวภาพ นักวิจัยยังศึกษาบทบาทของมันในการสังเคราะห์โมเลกุลชีวภาพสำหรับโรคทางระบบประสาท เนื่องจากคุณสมบัติโครงสร้างของมันสามารถเพิ่มการทะลุผ่านกำแพงเลือด-สมอง โดยรวมแล้ว 3-อะมิโน-2-ฟลูออโรเบนซาไมด์ ทำหน้าที่เป็นโครงสร้างพื้นฐานที่หลากหลายในการค้นพบยา สนับสนุนการพัฒนาการรักษาใหม่ๆ สำหรับภาวะทางการแพทย์หลากหลายประเภท