สารนี้ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์ยาเภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะยาแก้โรคจิตเภทไม่ปกติสำหรับรักษาโรคจิตเภทสกิโซฟรีเนียและโรคจิตอื่นๆ โครงสร้างเบนโซอิโซซาโซลเป็นส่วนสำคัญของยาที่ออกฤทธิ์ยับยั้งตัวรับเซโรโทนิน 5-HT2A และโดพามีน D2 ช่วยในการจัดการโรคทางระบบประสาทที่มีประโยชน์ต้านอาการวิตกกังวล นอกจากนี้ยังใช้ในการวิจัยพัฒนายารักษาโรคไบโพลาร์และภาวะระบบประสาทส่วนกลางอื่นๆ ความยืดหยุ่นของสารยังขยายไปสู่การประยุกต์ใช้ในอุตสาหกรรมเกษตรเคมี สำหรับการสังเคราะห์ยาฆ่าแมลงและวัชญากรที่มีความเลือกสรร