2,2-Difluoro-1,3-benzodioxole ใช้หลักๆ เป็นสารกลางสำคัญในการสังเคราะห์เภสัชภัณฑ์ต่างๆ โดยเฉพาะในการพัฒนาส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) ที่มุ่งเป้าไปยังโรคทางระบบประสาท โครงสร้างที่เป็นเอกลักษณ์ของมันช่วยให้ทำหน้าที่เป็นบล็อกก่อสร้างสำหรับสารประกอบที่แสดงกิจกรรมทางชีวภาพที่เพิ่มขึ้นและความเสถียร นอกจากนี้ ยังมีการประยุกต์ใช้ในงานวิจัยเคมีเกษตร ซึ่งช่วยในการสร้างยาฆ่าแมลงและสารกำจัดวัชพืชใหม่ที่มีประสิทธิภาพดีขึ้นและความปลอดภัยต่อสิ่งแวดล้อม ในด้านวิทยาศาสตร์วัสดุ มันถูกใช้ในการผลิตโพลิเมอร์พิเศษและสารเคลือบผิว ซึ่งให้คุณสมบัติทนความร้อนและทนสารเคมีที่เพิ่มขึ้น โครงสร้างที่มีฟลูออรีนยังทำให้มีคุณค่าต่อการพัฒนาวัสดุอิเล็กทรอนิกส์ขั้นสูง เช่น ที่ใช้ในไดโอดออแกนิกเรืองแสง (OLEDs) และอุปกรณ์อิเล็กทรอนิกส์ประสิทธิภาพสูงอื่นๆ