2,3,5,6-Tetrafluoroanisole ใช้หลักในการสังเคราะห์อินทรีย์และวิทยาศาสตร์วัสดุ โครงสร้างฟลูออรีนที่ไม่เหมือนใครทำให้เป็นสารตั้งต้นที่มีคุณค่าต่อการผลิตยา สารเคมีเกษตร และสารเคมีพิเศษ สารนี้มักใช้ในการพัฒนาวัสดุขั้นสูง เช่น ผลึกเหลวและโพลิเมอร์ เนื่องจากสามารถถ่ายทอดคุณสมบัติที่น่าปรารถนา เช่น ความเสถียรทางเคมีและความต้านทานต่อการย่อยสลาย นอกจากนี้ ยังทำหน้าที่เป็นบล็อกก่อสร้างในการสังเคราะห์โมเลกุลซับซ้อน โดยเฉพาะในปฏิกิริยาที่การนำอะตอมฟลูออรีนเข้าไปมีความสำคัญสำหรับการเพิ่มกิจกรรมทางชีวภาพหรือปรับเปลี่ยนลักษณะทางกายภาพ การประยุกต์ใช้ยังขยายไปสู่ด้านอิเล็กทรอนิกส์ โดยใช้ในการผลิตเซมิคอนดักเตอร์อินทรีย์และส่วนประกอบอิเล็กทรอนิกส์อื่นๆ