5-Methoxy-2-methylbenzofuran ใช้ในการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ โดยเฉพาะในการพัฒนายาและสารเคมีเกษตร เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสร้างโมเลกุลที่มีคุณสมบัติทางรักษา เช่น สารต้านการอักเสบและสารต้านจุลินทรีย์ นอกจากนี้ ยังใช้ในการวิจัยเพื่อศึกษาคุณสมบัติทางโฟโตฟิสิกส์ ซึ่งสามารถนำไปประยุกต์ในวิทยาศาสตร์วัสดุสำหรับพัฒนาออร์แกนิกไลท์-อีมิตติ้งไดโอด (OLEDs) หรือเซ็นเซอร์ โครงสร้างเบนโซฟูแรนทำให้มีคุณค่าในการออกแบบสารที่มีกิจกรรมทางชีวภาพเฉพาะหรือวัสดุฟังก์ชันนัล