กรด 3-อะมิโน-5-เมทอกซีเบนโซอิก ถูกใช้หลักในการสังเคราะห์สารประกอบเภสัชภัณฑ์ต่าง ๆ โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการผลิตยาที่เล็งเป้าไปยังภาวะทางการแพทย์เฉพาะเจาะจง โดยเฉพาะอย่างยิ่งในการพัฒนายาต้านการอักเสบและยาแก้ปวด คุณสมบัติโครงสร้างของมันทำให้มีคุณค่าในการสร้างโมเลกุลที่สามารถโต้ตอบกับเป้าหมายทางชีวภาพได้อย่างมีประสิทธิภาพ

นอกจากเภสัชภัณฑ์แล้ว สารประกอบนี้ยังถูกนำมาใช้ในการวิจัยเคมีอินทรีย์ในฐานะส่วนประกอบพื้นฐานสำหรับโครงสร้างทางเคมีที่ซับซ้อนมากขึ้น มันมักถูกใช้ในการสังเคราะห์สีย้อมและเม็ดสี ซึ่งมีส่วนช่วยในการพัฒนาสารให้สีที่ใช้ในงานอุตสาหกรรม กลุ่มอะมิโนและเมทอกซี่ของมันให้ความตอบสนองทางเคมีที่เป็นประโยชน์ในการออกแบบโมเลกุลอินทรีย์เฉพาะทาง

นอกจากนี้ กรด 3-อะมิโน-5-เมทอกซีเบนโซอิก ยังพบการประยุกต์ใช้ในสาขาเคมีเกษตร มันถูกใช้ในการสร้างสารกำจัดวัชพืชและยาฆ่าแมลง โดยโครงสร้างทางเคมีของมันช่วยในการจัดทำสูตรของสารประกอบที่สามารถเล็งเป้าไปยังศัตรูพืชหรือวัชพืชได้อย่างเลือกสรรโดยไม่เป็นอันตรายต่อพืชผล ทำให้เป็นส่วนประกอบที่มีคุณค่าในแนวปฏิบัติทางการเกษตรที่ยั่งยืน