เมทิล 4-ฟลูออโร-2-ฟอร์มิลเบนโซเอท ใช้หลักๆ เป็นสารกลางในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการผลิตเภสัชภัณฑ์และสารเคมีเกษตร โครงสร้างที่มีทั้งกลุ่มฟอร์มิลและสารย่อยฟลูออรี ทำให้เป็นบล็อกก่อสร้างที่หลากหลายสำหรับการสร้างโมเลกุลซับซ้อน มักใช้ในการพัฒนาสารออกฤทธิ์ทางเภสัชกรรม (APIs) โดยอะตอมฟลูออรีช่วยเพิ่มกิจกรรมทางชีวภาพและความเสถียรทางเมแทบอลิซึมของสารประกอบสุดท้าย นอกจากนี้ ยังเป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารประกอบเฮเทโรไซคลิก ซึ่งสำคัญในเคมียารักษาเพื่อออกแบบยาที่มีผลบำบัดเฉพาะ การประยุกต์ใช้ยังขยายไปถึงวิทยาศาสตร์วัสดุ สามารถใช้สร้างโพลิเมอร์หรือสารเคลือบพิเศษที่มีคุณสมบัติเฉพาะตัว นอกจากนี้ ยังใช้ในการวิจัยทางเคมีเพื่อศึกษาปฏิกิริยาและกลไกการเกิดสารใหม่ๆ