3,5-Difluoro-2-nitrobenzoic acid ถูกนำมาใช้เป็นสารตั้งต้นในกระบวนการสังเคราะห์สารเคมีที่มีความซับซ้อน โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมเภสัชกรรม ซึ่งใช้ในการผลิตยาชนิดต่าง ๆ เช่น ยาต้านเชื้อแบคทีเรียหรือยาต้านมะเร็ง นอกจากนี้ยังมีการนำไปใช้ในการวิจัยและพัฒนาสารเคมีใหม่ ๆ เพื่อศึกษาคุณสมบัติทางเคมีและชีวภาพ ในทางเคมีอินทรีย์ สารนี้ยังมีบทบาทสำคัญในการสร้างพันธะเคมีที่เฉพาะเจาะจง ซึ่งช่วยให้ได้ผลิตภัณฑ์ที่มีประสิทธิภาพสูงและมีความแม่นยำในการใช้งาน