4-Chloro-2-fluorobenzonitrile นิยมใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารเคมีต่าง ๆ ในอุตสาหกรรมยาและเกษตรกรรม เนื่องจากโครงสร้างที่มีทั้งหมู่คลอรีนและฟลูออรีนช่วยเพิ่มประสิทธิภาพในการทำปฏิกิริยา โดยเฉพาะในการผลิตสารกำจัดศัตรูพืชและยารักษาโรค นอกจากนี้ ยังใช้ในการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ที่มีความซับซ้อน ซึ่งเป็นส่วนสำคัญในการพัฒนายาใหม่ ๆ และวัสดุที่มีคุณสมบัติพิเศษ