2-Methoxy-5-nitrobenzonitrile ถูกนำไปใช้ในการสังเคราะห์สารเคมีที่มีความซับซ้อน โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมเภสัชกรรม ซึ่งมักใช้เป็นสารตั้งต้นหรือตัวกลางในการผลิตยาชนิดต่าง ๆ เช่น ยาต้านมะเร็งหรือยาต้านจุลชีพ นอกจากนี้ยังอาจใช้ในการวิจัยและพัฒนาสารเคมีใหม่ ๆ เพื่อศึกษาประสิทธิภาพและกลไกการออกฤทธิ์ของสารเหล่านั้น ในภาคอุตสาหกรรมอื่น ๆ อาจใช้เป็นส่วนประกอบในกระบวนการผลิตสีหรือสารเคมีเฉพาะทางอีกด้วย