2-Chloro-6-trifluoromethylbenzothiazole ถูกใช้หลักในการสังเคราะห์ยาและสารเคมีเกษตร โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญ มีคุณค่าอย่างยิ่งในการพัฒนาสารกำจัดวัชพืชและสารป้องกันเชื้อรา ซึ่งโครงสร้างของมันช่วยในการกำหนดเป้าหมายศัตรูพืชและโรคเฉพาะเจาะจง นอกจากนี้ ยังมีบทบาทในการสร้างวัสดุขั้นสูง รวมถึงโพลิเมอร์และสารเคลือบผิว เนื่องจากความสามารถในการมอบคุณสมบัติพิเศษ เช่น ความต้านทานการย่อยสลายและความทนทานที่เพิ่มขึ้น ในงานวิจัย ถูกนำมาใช้ในการศึกษาปฏิกิริยาเคมีและกลไก เพื่อช่วยในการค้นพบสารประกอบและกระบวนการใหม่ การประยุกต์ใช้ยังขยายไปสู่สาขาอิเล็กทรอนิกส์อินทรีย์ ซึ่งมีส่วนช่วยในการพัฒนาชิ้นส่วนสำหรับอุปกรณ์ เช่น เซ็นเซอร์และไดโอด发光