N-Methyl-N-propargylbenzylamine ถูกนำมาใช้หลักในกระบวนการสังเคราะห์อินทรีย์ในฐานะสารกลางที่หลากหลาย มักนำไปใช้ในการพัฒนาสารประกอบทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในการสังเคราะห์โมเลกุลที่มีคุณสมบัติป้องกันระบบประสาทที่อาจเกิดขึ้น กลุ่ม propargyl ในโครงสร้างของมันทำให้เป็นสารตั้งต้นที่มีคุณค่าในการทำปฏิกิริยา click chemistry ซึ่งช่วยให้เกิดการสร้างอนุพันธ์ triazole ที่มีความสำคัญในด้านการค้นพบยาและวิทยาศาสตร์วัสดุ นอกจากนี้ ยังถูกใช้ในการเตรียมโมเลกุลชีวภาพที่针对โรคทางระบบประสาท เช่น โรคพาร์กินสัน เนื่องจากความสามารถในการปรับกิจกรรมของ monoamine oxidase ส่วนของ benzylamine ยังมีส่วนช่วยในบทบาทในการสังเคราะห์ลิแกนด์สำหรับตัวรับต่างๆ ซึ่งช่วยในการศึกษากลไกทางชีวเคมี