เบริลเลียมฟลูออไรด์ถูกใช้หลักในการผลิตโลหะเบริลเลียมและโลหะผสมเบริลเลียม โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในกระบวนการสกัดเบริลเลียมจากแร่ของมัน สารนี้ยังถูกนำไปใช้ในการผลิตแก้วและเซรามิกพิเศษ ซึ่งช่วยเพิ่มความเสถียรทางความร้อนและความต้านทานต่อการกระแทกทางความร้อน ในอุตสาหกรรมนิวเคลียร์ เบริลเลียมฟลูออไรด์ถูกใช้เป็นส่วนประกอบในเครื่องปฏิกรณ์เกลือหลอมเหลว เนื่องจากสามารถละลายสารประกอบยูเรเนียมและทอเรียมได้ นอกจากนี้ ยังถูกนำไปใช้ในการสังเคราะห์สารประกอบเบริลเลียมอื่นๆ และในการวิจัยเนื่องจากคุณสมบัติทางเคมีที่เป็นเอกลักษณ์