ใช้เป็นตัวกลางสำคัญในสังเคราะห์สารประกอบทางเภสัชกรรม โดยเฉพาะในกระบวนการผลิตยาที่มีโครงสร้างเป็นไซโคลเฮกเซน ซึ่งมีหมู่อะมิโนที่ถูกป้องกันด้วย Boc และหมู่คาร์บอกซิลิกแอซิดที่เป็นอิสระ เพื่อควบคุมการเกิดปฏิกิริยาเฉพาะตำแหน่ง นิยมใช้ในการพัฒนาเปปไทโดมิมิติกส์และตัวยับยั้งเอนไซม์ โครงสร้างไซโคลเฮกเซนที่แข็งและมีสเตอรีโอเคมีแบบ trans ช่วยเพิ่มการควบคุมโครงสร้างในออกแบบยา โดยเฉพาะยา CNS และตัวยับยั้งโปรติเอส นอกจากนี้ยังใช้ในสังเคราะห์แบบเฟสของแข็งและเคมีแบบคอมบิเนตอเรียล เนื่องจากความเสถียรและความเข้ากันได้ของกลุ่มป้องกันแบบออร์โธกอนัล