เบนโซอิลอะซิโตนถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในการสังเคราะห์อินทรีย์ในฐานะสารตั้งต้นที่หลากหลาย มันมีบทบาทสำคัญในการผลิตยา โดยเฉพาะในการสังเคราะห์ยาต้านการอักเสบและยาต้านจุลินทรีย์ คุณสมบัติการจับเชลาตทำให้มีคุณค่าการเตรียมสารประกอบโลหะ ซึ่งถูกนำมาใช้ในการเร่งปฏิกิริยาและวิทยาศาสตร์วัสดุ นอกจากนี้ยังถูกนำมาใช้ในการผลิตสีย้อมและเม็ดสี ซึ่งมีส่วนช่วยในการสร้างสูตรสีที่สดใสและเสถียร ในเคมีวิเคราะห์ เบนโซอิลอะซิโตนถูกใช้เป็นรีเอเจนต์สำหรับการตรวจจับและแยกไอออนโลหะบางชนิด การประยุกต์ใช้ยังขยายไปสู่ด้านการเกษตร ที่ซึ่งมันมีส่วนร่วมในการสังเคราะห์สารเคมีเกษตร