เซฟควิโนม (Cefquinome) ใช้หลักในการแพทย์สัตว์เพื่อรักษาการติดเชื้อแบคทีเรียในสัตว์ โดยเฉพาะโคและสุกร มีประสิทธิภาพต่อเชื้อแบคทีเรียแกรมบวกและแกรมลบในวงกว้าง ทำให้เป็นตัวเลือกที่มีคุณค่าในการรักษาการติดเชื้อทางเดินหายใจในลูกโคและสุกร โดยทั่วไปใช้ในการจัดการโรคทางเดินหายใจในโค (BRD) ซึ่งเกี่ยวข้องกับเชื้อก่อโรคเช่น Mannheimia haemolytica, Pasteurella multocida และ Histophilus somni ในสุกร ใช้รักษาการติดเชื้อที่เกิดจาก Actinobacillus pleuropneumoniae และเชื้ออื่นๆ ที่ไวต่อยาที่เกี่ยวข้องกับโรคทางเดินหายใจ

เนื่องจากมีกิจกรรมครอบคลุมกว้างและการออกฤทธิ์ฆ่าเชื้อแบคทีเรียอย่างรวดเร็ว เซฟควิโนมจึงมักเลือกใช้ในกรณีที่ต้องการควบคุมการติดเชื้อรุนแรงอย่างรวดเร็ว สูตรของมันช่วยให้สามารถให้ยาเพียงวันละครั้ง ซึ่งช่วยเพิ่มการปฏิบัติตามในฟาร์ม ไม่ได้ใช้ในมนุษย์และจำกัดเฉพาะการใช้ในสัตว์เพื่อรักษาประสิทธิภาพของเซฟาลอสปอรินในทางการแพทย์มนุษย์