เซฟเมน็อกซิมใช้หลักในการรักษาการติดเชื้อแบคทีเรียหลายชนิด มีประสิทธิภาพสูงต่อแบคทีเรียแกรมบวกและแกรมลบ ทำให้เป็นตัวเลือกที่มีคุณค่าในการรักษาการติดเชื้อในระบบทางเดินหายใจ ระบบทางเดินปัสสาวะ โลหิตเป็นพิษ และการติดเชื้อในช่องท้องและช่องเชิงกราน กิจกรรมสเปกตรัมกว้างช่วยให้ใช้ได้ทั้งในโรงพยาบาลและชุมชน นอกจากนี้ยังใช้ในการป้องกันการติดเชื้อหลังการผ่าตัด ยานี้มักให้ทางหลอดเลือดดำหรือกล้ามเนื้อเพื่อการส่งยาที่รวดเร็วและมีประสิทธิภาพ ความเสถียรต่อเอนไซม์เบต้า-แลคตาเมสช่วยเพิ่มประสิทธิภาพในการรักษาเชื้อที่ดื้อยา