ใช้ Cyclosporin A Acetate เป็นหลักในทางการแพทย์เพื่อป้องกันการต่อต้านของร่างกายต่ออวัยวะที่ปลูกถ่าย เช่น ไต ตับ และหัวใจ โดยยับยั้งการทำงานของเซลล์ T ผ่านการยับยั้ง calcineurin ซึ่งลดการตอบสนองของระบบภูมิคุ้มกัน นอกจากนี้ยังใช้รักษาโรคภูมิต้านตนเอง เช่น สะเก็ดเงินรุนแรง ข้ออักเสบรูมาตอยด์ และผิวหนังอักเสบจากภูมิแพ้ รูปแบบ acetate ช่วยเพิ่มความละลายและความเสถียรในสูตรยา ทำให้เหมาะสำหรับการให้ยาทางปากและทางทา ยังมีการใช้ในรูปแบบหยอดตาเพื่อรักษาโรคตาแห้งจากภาวะภูมิต้านตนเอง และนำไปใช้ในการวิจัยเพื่อศึกษาการควบคุมระบบภูมิคุ้มกันและเส้นทางส่งสัญญาณเซลล์ที่เกี่ยวข้องกับ T-lymphocytes