ใช้เป็นสารฆ่าเชื้อชีวภาพในระบบบำบัดน้ำ โดยเฉพาะในหอระบายความร้อนและวงจรน้ำอุตสาหกรรม เพื่อควบคุมการเจริญเติบโตของจุลินทรีย์ รวมถึงแบคทีเรีย สาหร่าย และเชื้อรา โครงสร้างแอมโมเนียมไตรเทอร์นารีคู่ช่วยเพิ่มการรบกวนเยื่อหุ้มเซลล์ในจุลินทรีย์ ทำให้มีประสิทธิภาพในความเข้มข้นต่ำ นอกจากนี้ยังใช้เป็นสารฆ่าเชื้อในปฏิบัติการน้ำมันเพื่อป้องกันการสะสมของชีวภาพและการเปรี้ยวจากแบคทีเรียที่ลดซัลเฟต

นอกจากนี้ ใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารลดแรงตึงผิวที่มีประจุบวก โดยเฉพาะในอุตสาหกรรมสิ่งทอและหนัง เพื่อปรับปรุงคุณสมบัติการซึมผ่านของน้ำและการยึดเกาะของสี ยังนำไปใช้ในระบบการส่งยาแบบควบคุม โดยทำหน้าที่เป็นตัวพาที่ช่วยให้สารออกฤทธิ์เข้าสู่เซลล์ได้ดีขึ้น เนื่องจากมีโครงสร้างที่สามารถโต้ตอบกับเยื่อหุ้มเซลล์ได้ดี

ยิ่งไปกว่านั้น ทำหน้าที่เป็นตัวเร่งปฏิกิริยาแบบถ่ายโอนเฟสในสังเคราะห์อินทรีย์ และเป็นตัวปรับสภาพผิวในงานเตรียมวัสดุนาโน เช่น การสร้างไมโครแคปซูลหรือลิโพโซมที่มีเสถียรภาพสูง เนื่องจากมีโซ่ไฮโดรโฟบิกยาวและลักษณะไอออนิก