Fluorescein 6-isothiocyanate ถูกใช้อย่างแพร่หลายเป็นสารเคมีสำหรับติดฉลากเรืองแสงในชีวเคมีและชีววิทยาขนาดโมเลกุล มีคุณค่าอย่างยิ่งสำหรับการติดแท็กโปรตีน แอนติบอดี และชีวโมเลกุลอื่นๆ เนื่องจากมี fluorescence ที่แรงและสามารถก่อตัวพันธะโคเวเลนต์ที่เสถียรกับอะมีนปฐมภูมิ คุณสมบัตินี้ทำให้เป็นเครื่องมือหลักในกล้องจุลทรรศน์เรืองแสง, flow cytometry, และการทดสอบ immunofluorescence ซึ่งช่วยให้นักวิจัยสามารถมองเห็นและติดตามโมเลกุลเฉพาะในเซลล์หรือเนื้อเยื่อ นอกจากนี้ ยังใช้ในแอปพลิเคชันวินิจฉัย เช่น การตรวจจับและวัดปริมาณชีวโมเลกุลในตัวอย่างทางคลินิก ความไวสูงและความเข้ากันได้กับระบบตรวจจับต่างๆ ทำให้เป็นตัวเลือกที่หลากหลายสำหรับทั้งงานวิจัยและวัตถุประสงค์วินิจฉัย