ซี-เทโลเปปไทด์ถูกใช้ในการประเมินสุขภาพของกระดูก โดยเฉพาะในการวินิจฉัยและติดตามการรักษาโรคกระดูกพรุน เนื่องจากซี-เทโลเปปไทด์เป็นผลผลิตจากการสลายตัวของคอลลาเจนชนิดที่ 1 ในกระดูก ซึ่งสามารถตรวจพบได้ในเลือดหรือปัสสาวะ การวัดระดับซี-เทโลเปปไทด์ช่วยให้แพทย์ทราบถึงอัตราการสลายตัวของกระดูก ทำให้สามารถประเมินประสิทธิภาพของการรักษาและปรับเปลี่ยนวิธีการรักษาได้อย่างเหมาะสม นอกจากนี้ยังใช้ในการศึกษาวิจัยเกี่ยวกับโรคกระดูกและข้อ เพื่อทำความเข้าใจกลไกการเกิดโรคและการพัฒนายาใหม่ ๆ ที่เกี่ยวข้องกับกระดูกอีกด้วย