ไบโอตินเมทิลเอสเตอร์ถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในการวิจัยทางชีวเคมีในฐานะสารเรย์เจนต์สำหรับการติดฉลาก โดยมีคุณค่าอย่างยิ่งในการติดแท็กโปรตีน กรดนิวคลีอิก และชีวโมเลกุลอื่นๆ เนื่องจากความสามารถในการจับตัวกับอะวิดินหรือสเตรปโตอะวิดินอย่างแข็งแกร่ง คุณสมบัตินี้ทำให้จำเป็นสำหรับเทคนิคต่างๆ เช่น ELISA อิมมูโนฮิสโตเคมี และเวสเทิร์นบล็อตติ้ง เพื่อการตรวจจับและการทำให้บริสุทธิ์ นอกจากนี้ ยังถูกนำมาใช้ในการศึกษาเอนไซม์ที่ขึ้นกับไบโอตินและเส้นทางเมแทบอลิซึม เพื่อช่วยอธิบายกลไกและหน้าที่ของพวกเขา ความเสถียรและความจำเพาะยังทำให้เป็นเครื่องมือที่มีประโยชน์ในการค้นพบยาและการทดสอบวินิจฉัย