ใช้ในงานวิจัยด้านชีวโมเลกุล โดยเฉพาะในการติดฉลากโปรตีนหรือกรดนิวคลีอิกเพื่อการตรวจจับด้วยระบบสเตรปทาวิดิน-ไบโอทิน (streptavidin-biotin system) ซึ่งมีความจำเพาะและแข็งแรงสูง ช่วยเพิ่มความไวในการตรวจวัดในเทคนิคต่างๆ เช่น ELISA, การถ่ายภาพชีวภาพ (bioimaging), และการแยกสารชีวโมเลกุลผ่านแมทริกซ์ที่จับกับสเตรปทาวิดิน โครงสร้างไซโคลเพนเทนไดโอนช่วยทำให้เกิดปฏิกิริยาต่อเนื่องได้ง่ายกับหมู่ฟังก์ชันเป้าหมาย โดยเฉพาะในสภาพแวดล้อมที่มีน้ำ ทำให้เหมาะสมกับการใช้งานในระบบชีวภาพ