ใช้เป็นสารกลางในกระบวนการสังเคราะห์เภสัชภัณฑ์ โดยเฉพาะในการพัฒนาส่วนประกอบยาสำคัญ (APIs) ผ่านปฏิกิริยาการจับคู่ข้ามซูซูกิ-มิยาอูระ (Suzuki-Miyaura cross-coupling reactions) กลุ่มเอสเตอร์โบโรเนตช่วยให้เกิดการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนอย่างมีประสิทธิภาพ ทำให้มีคุณค่าในการสร้างโมเลกุลที่ซับซ้อนสำหรับการค้นพบยา ใช้บ่อยในการเตรียมตัวยับยั้งคินาส (kinase inhibitors) และสารชีวภาพอื่นๆ ที่ต้องการสถาปัตยกรรมโมเลกุลที่แม่นยำ ส่วนของไพเพอราซีนที่ได้รับการป้องกัน (protected piperazine moiety) ช่วยให้สามารถถอดการป้องกันอย่างเลือกสรรและการปรับแต่งเพิ่มเติม เพิ่มความยืดหยุ่นในเส้นทางสังเคราะห์หลายขั้นตอน