2-Methoxypyridine-3-boronic acid pinacol ester ใช้เป็นสารกลางสำคัญในกระบวนการสังเคราะห์สารอินทรีย์ โดยเฉพาะในปฏิกิริยา Suzuki-Miyaura cross-coupling ซึ่งถูกนำมาใช้อย่างแพร่หลายในอุตสาหกรรมเภสัชกรรมและเกษตรเคมีเพื่อสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอน กลุ่ม boronic ester ของมันช่วยอำนวยความสะดวกในการจับคู่ที่มีประสิทธิภาพกับ aryl หรือ vinyl halides ทำให้สามารถผลิตโมเลกุลที่ซับซ้อนได้ ใช้กันทั่วไปในการพัฒนาสารออกฤทธิ์ทางเภสัชกรรม (APIs) และเคมีภัณฑ์ละเอียด นอกจากนี้ยังใช้ในวิทยาศาสตร์วัสดุสำหรับสร้างวัสดุอินทรีย์ขั้นสูงและโพลิเมอร์ ความเสถียรและปฏิกิริยาของมันทำให้เป็นสารเคมีที่มีค่ามากในงานวิจัยและการประยุกต์ใช้ในอุตสาหกรรม