(Chloromethyl)boronic Acid Pinacol Ester ใช้ในการสังเคราะห์สารเคมีอินทรีย์ โดยเฉพาะในปฏิกิริยาการจับคู่ซูซูกิ (Suzuki coupling reaction) ซึ่งเป็นปฏิกิริยาที่สำคัญในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนระหว่างสารประกอบอริลหรือวินิลโบรอนิกเอซิดกับอริลหรือวินิลเฮไลด์ นอกจากนี้ยังใช้เป็นสารตั้งต้นในการผลิตสารเคมีอื่นๆ ที่มีโครงสร้างซับซ้อนในอุตสาหกรรมยาและวัสดุศาสตร์ เช่น การสังเคราะห์สารออกฤทธิ์ทางชีวภาพหรือโมเลกุลที่มีความสำคัญทางเภสัชกรรม