2-Methylquinoline-5-boronic Acid Pinacol Ester ใช้ในการสังเคราะห์สารเคมีที่เป็นส่วนประกอบสำคัญในอุตสาหกรรมยา โดยเฉพาะในกระบวนการ Suzuki coupling ซึ่งเป็นปฏิกิริยาที่ใช้สร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนระหว่างสารประกอบโบรอนและสารประกอบอาไรล์หรือวินิลฮาไลด์ สารนี้ยังมีบทบาทในการพัฒนายาและสารออกฤทธิ์ทางชีวภาพ เนื่องจากโครงสร้าง quinoline ที่มีอยู่ในโมเลกุลสามารถนำไปใช้ในการออกแบบและสังเคราะห์สารที่มีฤทธิ์ทางเภสัชวิทยาได้หลากหลาย เช่น ยาต้านมะเร็งหรือยาต้านจุลชีพ นอกจากนี้ยังใช้ในงานวิจัยทางเคมีเพื่อศึกษาปฏิกิริยาและกลไกการเกิดพันธะเคมีใหม่ ๆ