6-Amino-5-fluoropyridine-3-boronic Acid Pinacol Ester ใช้หลักในการทำปฏิกิริยา Suzuki-Miyaura cross-coupling ซึ่งเป็นวิธีที่นิยมอย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์อินทรีย์สำหรับการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอน กลุ่ม boronic ester ของสารนี้ช่วยให้ทำหน้าที่เป็น reagent สำคัญในการ coupling กับ aryl หรือ vinyl halides ส่งเสริมการสร้างโครงสร้าง biaryl ที่ซับซ้อน โครงสร้างเหล่านี้มีความสำคัญในการพัฒนายา สารเคมีเกษตร และวัสดุอินทรีย์ ส่วนของ fluoropyridine ยังช่วยเพิ่ม reactivity และ selectivity ทำให้มีคุณค่าการสังเคราะห์โมเลกุลที่มีฤทธิ์ทางชีวภาพ โดยเฉพาะในกระบวนการค้นคว้าและพัฒนายา นอกจากนี้ ยังใช้ในการเตรียมวัสดุขั้นสูง เช่น อิเล็กทรอนิกส์อินทรีย์ และผลึกเหลว เนื่องจากความสามารถในการนำอะตอมฟลูออรีนเข้าไปในโมเลกุลเป้าหมาย ซึ่งสามารถปรับเปลี่ยนคุณสมบัติทางอิเล็กทรอนิกส์