Diisopropyl allylboronate ใช้อย่างแพร่หลายในการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการก่อตัวพันธะคาร์บอน-คาร์บอน เป็นตัวเร่งที่มีคุณค่าต่อปฏิกิริยา allylation ซึ่งช่วยในการเพิ่มกลุ่ม allyl ไปยัง electrophiles ต่างๆ เช่น aldehydes, ketones และ imines กระบวนการนี้มีความสำคัญต่อการสังเคราะห์โมเลกุลอินทรีย์ที่ซับซ้อน รวมถึงยาและผลิตภัณฑ์จากธรรมชาติ ความสามารถของสารประกอบนี้ในการทำหน้าที่เป็นแหล่ง allyl ที่เสถียรและมีปฏิกิริยาสูง ทำให้เป็นตัวเลือกที่ชื่นชอบในการสังเคราะห์แบบ asymmetric ซึ่งช่วยให้ผลิตสารประกอบ chiral ด้วย enantioselectivity สูง นอกจากนี้ ยังใช้ในการเตรียม intermediates ที่มีโบรอน ซึ่งนำไปใช้ต่อในปฏิกิริยา cross-coupling และการแปลงอื่นๆ ในเคมียารักษาและวิทยาศาสตร์วัสดุ