Phenylboronic acid pinacol ester ใช้อย่างแพร่หลายในด้านการสังเคราะห์สารเคมี โดยเฉพาะในปฏิกิริยา Suzuki coupling ซึ่งเป็นปฏิกิริยาที่สำคัญในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนระหว่างสารประกอบ aryl หรือ vinyl halides กับ arylboronic acids ทำให้ได้สารประกอบที่มีโครงสร้างซับซ้อนมากขึ้น นอกจากนี้ยังใช้เป็นสารตั้งต้นในการสังเคราะห์สารเคมีต่างๆ เช่น ยา สารกำจัดศัตรูพืช และวัสดุอิเล็กทรอนิกส์ เนื่องจากมีความเสถียรและใช้งานง่ายในสภาวะปฏิกิริยา