สารประกอบนี้ถูกนำมาใช้หลัก ๆ ในกระบวนการสังเคราะห์อินทรีย์ โดยเฉพาะในการพัฒนายาเภสัชภัณฑ์ โดยทำหน้าที่เป็นสารกลางสำคัญในการเตรียมโมเลกุลซับซ้อน โดยเฉพาะสำหรับการประยุกต์ทางการแพทย์ กลุ่มโบรอนิกแอซิดช่วยให้สามารถเข้าร่วมในปฏิกิริยาครอสคัปปลิงแบบ Suzuki-Miyaura ซึ่งเป็นวิธีที่ใช้กันอย่างแพร่หลายในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอน ทำให้มีคุณค่าต่อการสร้างสารประกอบที่มีกิจกรรมทางชีวภาพ เช่น สารยับยั้งหรือตัวปรับตัวรับ นอกจากนี้ กลุ่มปกป้อง tert-butoxycarbonyl (Boc) บนส่วนของไพเพอราซีนช่วยให้สามารถถอดการปกป้องแบบเลือกสรรและปรับแต่งเพิ่มเติม ซึ่งเพิ่มความยืดหยุ่นในการค้นพบยาและการวิจัยเคมีทางการแพทย์ การนำไปใช้โดยเฉพาะมีความเกี่ยวข้องกับการสังเคราะห์สารประกอบสำหรับการรักษาโรคมะเร็ง (oncology) โรคระบบประสาท (neurology) และโรคติดเชื้อ