2,4-Bis(trifluoromethyl)benzeneboronic acid ใช้เป็นสารตั้งต้นสำคัญในการสังเคราะห์สารประกอบอินทรีย์ต่าง ๆ โดยเฉพาะในปฏิกิริยา Suzuki coupling ซึ่งเป็นปฏิกิริยาที่ใช้ในการสร้างพันธะคาร์บอน-คาร์บอนระหว่างสารประกอบโบรอนกับสารประกอบอะริลหรือวินิลฮาไลด์ สารนี้ยังถูกนำไปใช้ในการผลิตสารตัวกลางทางเภสัชกรรมและวัสดุที่มีความซับซ้อนทางเคมี นอกจากนี้ยังมีบทบาทในการวิจัยและพัฒนาโมเลกุลใหม่ ๆ ในอุตสาหกรรมยาและวัสดุศาสตร์