3-Acetamidophenylboronic acid ถูกนำมาใช้อย่างกว้างขวางในด้านเคมีอินทรีย์และชีวเคมี โดยเฉพาะในกระบวนการสังเคราะห์สารเคมีและการพัฒนายา มันมักถูกใช้เป็นสารตั้งต้นหรือรีเอเจนต์ในการสร้างสารประกอบที่มีโครงสร้างซับซ้อน เนื่องจากกลุ่มบอโรนิกแอซิดสามารถทำปฏิกิริยาได้ดีกับสารประกอบอื่นๆ เช่น แอลกอฮอล์หรือไดออล ทำให้เหมาะสำหรับการสังเคราะห์โมเลกุลเป้าหมาย นอกจากนี้ ยังมีการนำไปใช้ในการวิจัยทางเภสัชกรรมเพื่อพัฒนายาใหม่ๆ โดยเฉพาะยาที่เกี่ยวข้องกับการรักษาโรคมะเร็งและโรคติดเชื้อ เนื่องจากโครงสร้างของมันสามารถปรับเปลี่ยนได้ง่ายเพื่อเพิ่มประสิทธิภาพและความจำเพาะเจาะจงของยา